MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia psittaci 84/55 chromosome

Total Repeats: 24869

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018619	GTT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018619	AGA	3	9	75	83	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_018619	TA	3	6	93	98	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018619	CGA	2	6	170	175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_018619	AGA	2	6	188	193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_018619	CTT	2	6	225	230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_018619	T	6	6	256	261	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_018619	AAGG	2	8	265	272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018619	A	6	6	273	278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018619	GT	3	6	308	313	0 %	50 %	50 %	0 %	407453477
11	NC_018619	TCT	2	6	330	335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453477
12	NC_018619	A	7	7	477	483	100 %	0 %	0 %	0 %	407453477
13	NC_018619	TG	3	6	497	502	0 %	50 %	50 %	0 %	407453477
14	NC_018619	TAT	2	6	552	557	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453477
15	NC_018619	ATG	2	6	578	583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453477
16	NC_018619	GCGT	2	8	587	594	0 %	25 %	50 %	25 %	407453477
17	NC_018619	TGT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453477
18	NC_018619	ATG	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453477
19	NC_018619	TC	3	6	726	731	0 %	50 %	0 %	50 %	407453477
20	NC_018619	ACA	2	6	949	954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453477
21	NC_018619	AGC	2	6	963	968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453477
22	NC_018619	GTG	2	6	980	985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453477
23	NC_018619	AGC	3	9	999	1007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453477
24	NC_018619	CTA	2	6	1010	1015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453477
25	NC_018619	GGT	2	6	1019	1024	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453477
26	NC_018619	CTT	2	6	1127	1132	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453477
27	NC_018619	TTC	2	6	1145	1150	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018619	GAA	2	6	1151	1156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018619	CTT	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
30	NC_018619	AC	3	6	1294	1299	50 %	0 %	0 %	50 %	407453478
31	NC_018619	TTAA	2	8	1352	1359	50 %	50 %	0 %	0 %	407453478
32	NC_018619	ACA	2	6	1364	1369	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453478
33	NC_018619	ATG	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
34	NC_018619	GT	3	6	1460	1465	0 %	50 %	50 %	0 %	407453478
35	NC_018619	TTA	2	6	1511	1516	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453478
36	NC_018619	TAG	2	6	1575	1580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
37	NC_018619	TC	3	6	1583	1588	0 %	50 %	0 %	50 %	407453478
38	NC_018619	TAG	2	6	1713	1718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
39	NC_018619	CTA	2	6	1767	1772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453478
40	NC_018619	TTC	2	6	1788	1793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
41	NC_018619	TG	3	6	1887	1892	0 %	50 %	50 %	0 %	407453478
42	NC_018619	ATA	2	6	1988	1993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453478
43	NC_018619	CTT	2	6	2055	2060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
44	NC_018619	GAA	2	6	2066	2071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453478
45	NC_018619	TGA	2	6	2127	2132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
46	NC_018619	GAT	2	6	2145	2150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453478
47	NC_018619	GTT	2	6	2181	2186	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453478
48	NC_018619	CTT	2	6	2205	2210	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453478
49	NC_018619	T	6	6	2209	2214	0 %	100 %	0 %	0 %	407453478
50	NC_018619	T	8	8	2288	2295	0 %	100 %	0 %	0 %	407453478
51	NC_018619	TAA	2	6	2367	2372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453478
52	NC_018619	GAA	2	6	2414	2419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453478
53	NC_018619	AGAT	2	8	2542	2549	50 %	25 %	25 %	0 %	407453478
54	NC_018619	T	8	8	2616	2623	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
55	NC_018619	T	7	7	2628	2634	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
56	NC_018619	AGT	2	6	2641	2646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453479
57	NC_018619	TTA	2	6	2654	2659	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
58	NC_018619	TCC	2	6	2683	2688	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407453479
59	NC_018619	T	6	6	2728	2733	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
60	NC_018619	TTC	2	6	2776	2781	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453479
61	NC_018619	GA	3	6	2784	2789	50 %	0 %	50 %	0 %	407453479
62	NC_018619	TTA	2	6	2801	2806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
63	NC_018619	TGTT	2	8	2839	2846	0 %	75 %	25 %	0 %	407453479
64	NC_018619	T	6	6	2883	2888	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
65	NC_018619	T	6	6	2895	2900	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
66	NC_018619	AGA	2	6	2932	2937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453479
67	NC_018619	GAAG	2	8	2950	2957	50 %	0 %	50 %	0 %	407453479
68	NC_018619	TAT	2	6	2970	2975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
69	NC_018619	AGTA	2	8	2980	2987	50 %	25 %	25 %	0 %	407453479
70	NC_018619	TAT	2	6	3004	3009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453479
71	NC_018619	T	6	6	3009	3014	0 %	100 %	0 %	0 %	407453479
72	NC_018619	TAT	2	6	3056	3061	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_018619	ATT	3	9	3071	3079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_018619	TGT	2	6	3084	3089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_018619	T	6	6	3100	3105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_018619	GAA	2	6	3215	3220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453480
77	NC_018619	TTTG	2	8	3298	3305	0 %	75 %	25 %	0 %	407453480
78	NC_018619	TCCT	2	8	3324	3331	0 %	50 %	0 %	50 %	407453480
79	NC_018619	GA	3	6	3338	3343	50 %	0 %	50 %	0 %	407453480
80	NC_018619	GAAAA	2	10	3354	3363	80 %	0 %	20 %	0 %	407453480
81	NC_018619	ATG	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453480
82	NC_018619	AGT	2	6	3487	3492	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453480
83	NC_018619	CTT	2	6	3541	3546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453480
84	NC_018619	G	6	6	3584	3589	0 %	0 %	100 %	0 %	407453480
85	NC_018619	CAA	2	6	3627	3632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453480
86	NC_018619	ATG	2	6	3660	3665	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
87	NC_018619	ATC	2	6	3778	3783	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407453481
88	NC_018619	TGG	2	6	3891	3896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453481
89	NC_018619	AGA	2	6	4142	4147	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
90	NC_018619	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	407453481
91	NC_018619	TAA	2	6	4208	4213	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453481
92	NC_018619	AT	3	6	4226	4231	50 %	50 %	0 %	0 %	407453481
93	NC_018619	GAA	2	6	4245	4250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
94	NC_018619	AGC	2	6	4283	4288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407453481
95	NC_018619	TAA	2	6	4312	4317	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	407453481
96	NC_018619	AGGAG	2	10	4412	4421	40 %	0 %	60 %	0 %	407453481
97	NC_018619	AGA	2	6	4432	4437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
98	NC_018619	CTT	2	6	4449	4454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453481
99	NC_018619	ATG	2	6	4473	4478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
100	NC_018619	GAT	2	6	4524	4529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453481
101	NC_018619	GCT	2	6	4578	4583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453481
102	NC_018619	CT	3	6	4728	4733	0 %	50 %	0 %	50 %	407453481
103	NC_018619	GAA	2	6	4808	4813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
104	NC_018619	CTGTGG	2	12	4819	4830	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	407453481
105	NC_018619	AAG	2	6	4831	4836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
106	NC_018619	TGG	2	6	4909	4914	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453481
107	NC_018619	AAG	2	6	5008	5013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
108	NC_018619	AGA	2	6	5111	5116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453481
109	NC_018619	TTA	2	6	5131	5136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453481
110	NC_018619	CAA	2	6	5219	5224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453481
111	NC_018619	GAAA	2	8	5254	5261	75 %	0 %	25 %	0 %	407453481
112	NC_018619	CAA	2	6	5337	5342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_018619	TTG	2	6	5348	5353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
114	NC_018619	AATC	2	8	5413	5420	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
115	NC_018619	T	7	7	5456	5462	0 %	100 %	0 %	0 %	407453482
116	NC_018619	AGA	2	6	5519	5524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453482
117	NC_018619	CGAG	2	8	5525	5532	25 %	0 %	50 %	25 %	407453482
118	NC_018619	TGG	2	6	5585	5590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407453482
119	NC_018619	TAT	2	6	5620	5625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	407453482
120	NC_018619	GTT	2	6	5666	5671	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
121	NC_018619	CAA	2	6	5682	5687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
122	NC_018619	GAT	2	6	5709	5714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
123	NC_018619	TGT	2	6	5729	5734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
124	NC_018619	GGA	2	6	5751	5756	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453482
125	NC_018619	T	6	6	5785	5790	0 %	100 %	0 %	0 %	407453482
126	NC_018619	CAA	2	6	5862	5867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407453482
127	NC_018619	TGA	2	6	5924	5929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
128	NC_018619	GAT	2	6	5930	5935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
129	NC_018619	TGT	3	9	5982	5990	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
130	NC_018619	TGA	2	6	6046	6051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
131	NC_018619	GCT	2	6	6062	6067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453482
132	NC_018619	T	7	7	6071	6077	0 %	100 %	0 %	0 %	407453482
133	NC_018619	TGC	2	6	6221	6226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407453482
134	NC_018619	TGA	2	6	6242	6247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407453482
135	NC_018619	GAA	2	6	6273	6278	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407453482
136	NC_018619	A	6	6	6277	6282	100 %	0 %	0 %	0 %	407453482
137	NC_018619	GAG	2	6	6286	6291	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453482
138	NC_018619	TTC	2	6	6296	6301	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453482
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140	NC_018619	CTT	2	6	6349	6354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407453482
141	NC_018619	GTT	2	6	6391	6396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	407453482
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399	NC_018619	GGA	2	6	18862	18867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407453493
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